> JVNDB-2015-008097 は jQuery 3.0.0 未満のすべてのバージョンが対象というわけではないのですね。

はい、その通りです。とはいえ、jQuery 1 系はメンテナンスが止まっているバージョンですので、未知の脆弱性が存在する可能性は否定できません。
バージョン9でjQueryが3系にアップデートするのは、コミュニティとしても待望のアップデートになります。