新しく作ったらいける？なんでだ．．．とりあえずそれで回避します。

いや、ページごとにカノニカルURL設定があるんですよ

え？ページごとに？属性にはないよ．．

わかった〜！！
場所にあるんだ、助かりました。

これ、リニューアルの時にスタティックコンテンツと併用させて
PrettyURLなしで制作をすすめて、スタティックのindex.htmlを消してリニューアルするパターンの作業のとき、１つ１つ場所でカノニカルURLを保存しなおさないとダメですね。
これはまります。

すいません全ページSSL化もカノニカルでするんですか？
設定が見当たりません。
SSL Selectという有料プラグインも買ったのですが、どうもうまくいかず
今サポートで質問しています。

http://www.newsite.co.jp/jp/contact-us

でSSL Selectをオンにすると

http://www.newsite.co.jphttp://www.newsite.co.jp/jp/contact-us

になってしまいます。
これのカノニカル絡みでしょうか？

カノニカルURLの設定で行います。ただ、Force SSLのような機能ではないです

うーん、SSLの設定がどうもPretty URLのところのカノニカルを入れても空にしてもうまくいかない．．．なんでだろう

SSL Selectでサポートチケットで問い合わせすると、やはり5.7.4でおかしかったようで
現在公開されている1.0.3ではうまくいきません。
サポートで添付してもらった1.0.4をインストールすると、うまくいきました。
そのうちアップデートされると思います。
Force SSLと同じ使い方ができます。
ご報告まで