flatstrapはBootstrap2.3.2を使用しているようですので、このような出力に調整すればうまく表示されると思います

<ul class="nav nav-pills nav-stacked">
<li class="active"><a href="#">Home</a></li>
<li><a href="#">Profile</a></li>
<li><a href="#">Messages</a></li>
</ul>

http://getbootstrap.com/2.3.2/components.html#navs

acliss様

教えられたとおり実行したら、一発で思ったことが実現できました。
色は自分でオレンジ色に変えました。これも簡単でした。

こんなにも早く、こんなにも的確に、回答いただけるとは思ってもいませんでした。
本当に感謝しています。

また、hissy様もご指導、ありがとうございます。

ホームページのちょっとした変更が、業者に頼まずともすぐできるというのが、concrete5の魅力です。
皆様のご尽力に感謝します。

このテーマはbootstrapというcssフレームワークを使用しているということですので
僕がお渡ししたカスタマイズ方法では、実現はできますが、あまりお作法としては良くないかもしれません。カスタムテンプレートを多用されるとデザインが崩れる可能性もありますのでご注意ください。