いろんな可能性があるので下記で解消されるかわかりませんが

アドオンのアップロード先はconcrete5をインストールされたフォルダ内のpackagesフォルダ内に全てあります。
有料ではない場合、concrete5本家サイトhttp://www.concrete5.org/marketplace/addons からダウンロードできますのでそれをFTPでアップロードする形になります。

あーよかったです。Fancy Image Links だけでも元に戻りました。
有料テーマ Silence の方はダウンロードできないので、一時的にライセンスを別サイトに紐付けてアップロードしてとか、なんとか模索してみます。
この度はありがとうございました。

もしかすると、files/trashフォルダにあるかもしれません。一度探してみてください。

あー、ありました！
はい、全部解決しました。＼(^　^)／ ありがとうございました！

一回で説明できず申し訳ありませんでした。
また、インストールされているバージョンと、packagesフォルダのアドオンのバージョンが一緒かどうかもチェックしておいてください。
アドオンのバージョンの確認方法
・インストールされているバージョン　[管理画面→concrete5を拡張] で表示される一覧表の末尾の部分
・packagesフォルダの各アドオンのcontroller.php の
protected $pkgVersion = 'xx.xx'; と書かれているxx.xxの部分

上記に相違がある場合はアドオンがうまく動作しない可能性があります。ご注意ください。

いえいえ、とんでもありません、恐縮です。

はい、バージョンの整合性も確認しました。
これでひと安心です。ありがとうございました。