ご教示ありがとうございます。

そもそも、最初の要求時にステータスコード301で返ってくるので、concrete5ではないのではと思っています。
現在、さくらインターネットに問い合わせしています。
回答が来るまで、しばらくお待ちください。

読んだけどわからなかった。

わかった事は、直接htaccess.txtを作って、インストールディレクトリーにＦＴＰして
名前を.htaccessにする事でした。