ブロックとページは別々のテーブルに保存されていますが、クリップボードからペーストした状態では両方のページに同じブロックが表示されているようですね。編集したタイミングで新しいブロックが保存されるみたいです。5.6になってからブロックの編集がバギーなので、また修正アップデートがかかるでしょう…。

別のページにコピペでは問題なくいきますね。
同じページにコピペして、それを編集したら元のブロックが更新されてしまったような挙動を感じました。勘違いかもしれません。

同じページにペーストして編集してみましたが、切り離されてました。何かの条件でうまくいかないのかもしれません。