ちゃんと/languagesディレクトリの事も書いてあったんですね、すいません。
updatesディレクトリに関してですが、5.4.0.5のインストーラでディレクトリ作っちゃった方が良くないですか?
5.4.0.5へのアップグレード時の注意点
2010年5月21日 at 11:45
/concreteディレクトリ以外に、/languagesディレクトリもアップロードする必要があります。
あと、更新ファイルをアップロードした後はダッシュボードがエラーで表示されないので、
http://【concrete5のURL】/index.php/tools/required/upgrade.php
を直接叩く必要があります。
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Katz Ueno
Re: 5.4.0.5へのアップグレード時の注意点
http://concrete5-japan.org/help/install/how_to_upgrade/
ただ!
自動アップデート機能を利用するために
/updates/ ディレクトリーを作成
/updates/ ディレクトリーにサーバーが書き込みできるように権限設定をする
ことを忘れないで下さい。