確認をしてみましたが、以下のフォルダーだけでした。

関係はないとは思いますが、テーマのダウンロードでインストールしたテーマはエラーにはなりません。

core
dark_chocolate
dashboard
default
greek_yogurt
greensalad

あとは、ファイルがすべてアップロードされていない、パーミッションの問題でconcrete5から読み込みできない、などがあります。