実はブロックを配置する場所やらパディング、ライン等の大まかな
レイアウトを作成しただけで、デザインはまだ殆ど手をつけてませんｗ

hissyさんの仰るとおりhtmlで実際にページ作ってから、
php,cssを編集してテーマ作った方が良いなぁ、と今になってちょっと後悔していますｗ

ちなみに「オートナビ」ブロックはcss修正後は添付画像のように
カスタムテンプレートがちゃんと適用されています。