Re: concrete5をサイトのルートにするには？

設定と、index.phpをいじればいけると思います。
index.phpで

require('concrete/dispatcher.php');

となっているので、ココを

require('c5/concrete/dispatcher.php');

とかに変えてあげる必要があります。

静的なURL設定を行っているのであれば、.htaccessもいじる必要があると思います。（確認してないので何とも言えませんが、.htaccessの変更だけでもいけそうな気がします。）