codaっていうのはデバッガというかデバッグのときに役立つ機能はあるのでしょうか。

eclipseで、ZendFrameworkのようなclassのメソッドにブレークポイントを設定して、変数の中をみたり変更してみたりとかできるんでしょうか。
そうであれば、勉強できる本とか、Webサイトとかお教えいただけるとありがたいのですが。

＃用語の使い方がおかいいかも。

eclipseでPDTとかZend Debugerとか入れればわかります。
codaではブレークポイントの設定とかは出来ません。（プラグインで出来るかもしれません）

簡単なダンプであれば

print_r($GLOBALS);

とか

print_r($this);

を適当なとこに書けば表示されますよ。

勉強出来る本と言うか、ソースコード読んだ方が良いと思います。